Merci à vous 2 pour vos réponses.
Après recherche, je suis finalement tombé sur la balise <noembed> et j'ai donc recopié le texte à l'intérieur (avec un peu de mise en forme, tout de même), ainsi que les liens du menu flash.
Je pense que c'est le même principe que celui évoqué par dragondz non ?
De plus, ce site n'est pas entièrement en flash, je me suis mal exprimé. Il y bien plusieurs pages, à l'intérieur desquelles se trouvent généralement une balise object contenant le swf (qui contient le texte). C'est pour ça que j'avais envoyé tous les liens à google via sitemaps.
Ensuite, oui, il faut faire du licking, mais ça me parait cohérent que dans un premier temps google voit correctement le site en entier
PS: bizarre, je n'ai pas reçu de notification de réponse, pourtant j'ai bien coché la case "activer la notification ...". Heureusement que je passais par là et que j'ai fait F5