A noter que le plus simple et le plus courant dans un annuaire est de créer une page se chargeant de la redirection et du décompte.
Ton lien deviendrait <a href="redirect.php?id={id}">Lien</a>
Et dans ta page redirect.php, tu te charges du compteur et de la redirection. Cela fait certes une étape de plus pour l'utilisateur, mais normalement quasi-transparente, et j'avoue que la méthode est plus souple (à supposer que tu aies envie de rajouter des choses par la suite, des stats sur les navigateurs...). De plus, elle ne nécessite pas l'utilisation du javascript (à éviter aussi souvent que possible à mon avis).
C'est juste une idée, tu as sûrement une bonne raison de préférer l'utilisation de javascript (auquel cas, merci de repréciser exactement ce que tu veux faire, ouvrir une nouvelle fenêtre ?)