Salut Tema,
Les 2 propriétés qui t'intéressent se trouvent dans le lien de Xavier, à savoir :
top : la position verticale de la fenêtre par rapport au bord supérieur de l'écran (exprimée en pixels) ;
left : la position horizontale de la fenêtre par rapport au bord gauche de l'écran (exprimée en pixels) ;
Ainsi tu pourras positionner tes popups comme tu le sens.
Sinon je trouve le look du site très sympa.
Bon courage