Salut,
tu as tes classes ici
"D:/rep1/Apache/Classes/"
et tes sites
"D:/rep1/Apache/site1/"
"D:/rep1/Apache/site2/"
...
il te suffit de remonter physiquement à l'aide de ".."
Ex:
Dans la page index.php, pour atteindre un fichier situé dans ta bibliothèque partagée tu fais :
require "../Classes/tonfichier.inc.php";