Comme le dit KaZhaR, le mieux, c'est de comparer. Mais pour répondre plus directement à ta question, un outil log te permet des analyses certes intéressantes, mais plus compliquées à interpréter:
sessions hits taille de fichiers.... ce sont surtout des analyses de ressources serveur.
Tandis qu'un outil marqueur va vraiment te fournir une analyse de l'audience, à savoir une analyse de la fréquentation de ton site par des personnes physiques connectées à internet à travers un navigateur. (les outils logs te mélangent les machines si elles ont la même IP, reconnaissent seulement les robots les plus connus... et encore...)
Bref, à mon humble avis, mais cela dépend aussi de l'utilisation que tu auras d'un tel outil, le log oui, mais pas sans outil marqueur.
Après, tu as tous les outils gratuits, Xiti, Weboscope, Estat, PHPMyVisites etc... et les outils payants; avec ceux-là, c'est un régal... tu redécouvres réellement ton site. Certes, ça pioche quelque peu dans le porte-feuille, mais la rentabilité est énorme. Celui que j'utilise, Wysistat, me permet entre autres de contre-mesurer mes visites Adwords. J'utilise Adwords surtout pour tester de nouveaux mots-clés et, grâce à Wysistat, avoir un détail des achats pour chaque mot-clé (l'analyse est aussi faire pour le référencement naturel). Une fois que j'ai trouvé des mots-clés qui sont assez souvent tapés et qui transforment bien, je me donne la peine d'optimiser mon référencement pour ces mots...
A côté de ça, rien que les interfaces de présentation sont 100 fois plus agréables... Va voir celle d'Estat, en Flash ou celle de Wysistat, elles sont vraiment sympas.